Une chose manquait cruellement dans le binaire de pure-ftpd sur Debian Sarge : la gestion des liens symboliques. Il fallait passer par des "mount --bind ..." pour arriver à ses fins (cf. la documentation sur le sujet).
Fort heureusement, sur Debian Etch c'est résolu... Encore faut-il le trouver ! Il y a deux binaires pure-ftpd-mysql et pureftp-mysql-virtualchroot (dans mon cas, vous l'aurez deviné, j'utilise le support Mysql).
Pour activer le "virtualchroot", éditez le fichier /ect/default/pure-ftpd-common et ajoutez la ligne
VIRTUALCHROOT=true
Relancez le tout avec /etc/init.d/pure-ftpd-mysql restart
Supprimez vos mount --bind 
